隨著飛空船的登場，得以向無邊無際的天空進發的人們，不久便發現了飄浮在空中的廣闊大地。埃姆里思和阿奇德兩人被謠言激起了冒險心，前往空中大地，結果一抵達就被捲入了紛爭之中。阿奇德在戰鬥中從飛空船上墜落，救了他的是住在飄浮大陸上的有翼居民──哈耳庇厄。之後，阿奇德便與哈耳庇厄一起行動，同時也正面迎接沉睡於飄浮大陸上的重大秘密：源素晶石──這種飛空船不可或缺的物資就沉睡在這片大地之下。覬覦礦脈的各國接連登陸。有踩平大地的幻晶騎士大部隊、貪婪的商人，還有來自沉睡北地的巨人，檯面下更有黑騎士們暗中活動──在這片愈發混亂的飄浮大陸中，那個人終於出現了！